Ambas são utilizadas para a avaliação da qualidade das águas em rios, águas para consumo humano e efluentes. No entanto, cada uma possui um objetivo específico e metodologia aplicada.
A análise de cor verdadeira é realizada com amostras filtradas e a análises de cor aparente com a amostra pura (sem filtração). As portarias de água para consumo humano e a avaliação de potabilidade é realizada com a análise de Cor Aparente (sem filtração), enquanto a avaliação na CONAMA 357 é realizado com base na cor verdadeira.
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